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日前Q中国热带农业科学院“橡胶树(wi){主要热带作物功能基因组学研I”创新团队负责搭建的胶?wi)HeveaDB基因l数据库q_Qhevea.catas.cnQ上U运行,q在国际胶研究与发展委员会(x)QIRRDBQ各成员国间开展测试工作。经q?个月的测试,数据库^台各Ҏ(gu)标保持稳定,q行可靠Q达到预期效果?/span>
q年来,随着基因l测序技术的q步Q已有四个国Ӟ马来西亚、泰国、中国和日本Q独立绘制ƈ公开发表了橡胶树(wi)基因l草图,其中׃国热带农业科学院胶研究所完成的草囄本质量最高。同时还产生了大量{录组数据。这些数据亟需一个整合的数据q_来储存、分发和׃nQƈq行二次挖掘利用?/span>
2017q召开的IRC2017国际胶?x)议提出要搭建橡胶?wi)基因l数据中心的计划。在IRRDB理事?x)上Q中国热U院代表l过争取Q获得了牵头搭徏?qing)胶树(wi)基因组数据中心的Q务,q由“橡胶树(wi){主要热带作物功能基因组学研I”创新团队承担开发工作。经q努力,创新团队成功搭徏了橡胶树(wi)基因l数据库HeveaDB初期版本Qƈ?018q?月底在国内外开展试q行试?/span>
HeveaDB数据库主要储存了胶?个版本的基因l草图?个遗传图谱?42个{录组数据?9235条EST序列?0200个基因注释?2个基因家族的信息Q以?049个IRRDB 1981’野生种质资源材料和18328个魏克汉材料信息。ƈ以中国热U院胶研究所完成的热?-33-97品种的基因组数据为参考基因组Q进行了二次挖掘和分析,q行可视化展C?/span>
l过1个月的试q行QHeveaDB数据库访问量辑ֈ1600余次Q共有来自中国、马来西亚、法国、巴ѝ日本、印度、越南、英国、印度尼西亚{?0余个国家和地区的200多位独立访客点击讉KQ反馈了意见和徏议。下一步,根据徏议在数据库易用性、后基因l数据分析等斚wq行二次开发和功能升QƈҎ(gu)胶?wi)基因组研究q展?qing)时更新数据内容?/span>