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特定基因H变可能?x)导致肿瘤细胞(yu)生特D行为,例如Q超药性等。在zȝ?yu)内、单l胞(yu)水^上探索基因突变与zȝ?yu)行为相x能够ؓ(f)临床ȝ提供更加_և可靠的参考?
q日Q北京航I天大学常凌乾Nl在著名期刊Nano Letters上发表了一名为“Single Living Cell Analysis Nano-platform for High-throughput Interrogation of Gene Mutation and Cellular Behavior?的研I论文。ƈ被选ؓ(f)当期的内面文章。开发了一U新型活l胞(yu)阵列研究q_Q通过U米?sh)递送技术将一U可原位信号攑֤的Domino荧光探针高效地递送至zȝ?yu)内Q在单细?yu)水qx细?yu)内基因H变。同时芯片具备细?yu)寻址的功能,可实现肿瘤细?yu)耐药性的原位分析Q图1Q。在研究临床肺癌l胞(yu)h时发玎ͼ肺癌某些基因H变l胞(yu)比例与细?yu)对靶向药敏感程度呈现正相关性。此q_为单l胞(yu)分析、胞(yu)内基因检提供了一U通用Ҏ(gu)Q在指导临床_ևȝ斚wh较大的应用潜力?
?. 单细?yu)分析纳c_^台原理示意图。(aQ基于微孔阵列的U米芯片在单个活l胞(yu)中检靶标RNA的原理。(bQDomino探针与靶标RNAl合前(OFFQ后QONQ的构象变化C意图。(cQ纳c片用于将Domino探针递送到zȝ?yu)中Qƈ提供每个l胞(yu)的位|信息。(dQ芯片分层装配示意图?/span>
EGFRH变在肺癌基因突变中存在率最高。尽EGFR靶向药物可有效g长?zhn)者存?gu)zLQ但肿瘤l胞(yu)易生耐药性,造成靶向药物失效。预?zhn)者是否存在EGFRH变Qƈ推断其肿瘤细?yu)对靶向药物的耐药性,在提高肺癌治疗效果中L(fng)关键作用。作者设计了一U名为“Domino”的DNA探针。此探针利用基互补配对原则Q通过成对的发夹DNA序列l装形成紧密的螺旋链。与传统的分子信标相比,Domino探针被靶标RNA识别的反应速度加快?倍,荧光信号增强?0倍。ؓ(f)递送此探针Q作者开发了一U纳c_?sh)递送芯片,Domino探针递送到位于可寻址微孔中的数百万个的肺癌细?yu)中Q实现细?yu)内的EGFR基因H变?gu)(?Q?
?. U米q_细?yu)内的基因突变。(aQ微孔阵列靶向L858RH变的Domino探针H1975l胞(yu)QEGFR L858RH变Q。比例尺Q?0 μm。(bQ纳c_^台检肺癌细?yu)H1975QL858RH变Q,HCC827Q?9外显子缺q变)和A549Q野生型QEGFR L858R?9外显子缺q变的荧光图。比例尺Q?0 μm。(cQ,QdQ和QeQ纳c_^台检肺癌细?yu)H1975QcQ,HCC827QdQ和A549QeQEGFR L858R?9外显子缺q变的式l果。(fQ采用流式细?yu)A的H1975QHCC827和A549l胞(yu)的突变细?yu)阳性率。(gQ统计微孔阵列上H变l胞(yu)的阳性率。(hQSLCAU米q_针对H1975QHCC827和A549l胞(yu)的加载效率,递送效率和l胞(yu)zȝ?/span>
作者利用该q_研究了肺癌?zhn)者(f)床样品中单个zȝ?yu)的基因H变Q揭CZEGFRH变Q?1外显子L858R?9外显子E746-A750~失H变Q与相应的靶向药物耐受性之间存在明昄正相x(?3Q。该工作中提出的U米q_实现原位l胞(yu)培养Q活l胞(yu)内基因探以?qing)时I可控的l胞(yu)行ؓ(f)分析?
?. 原代肿瘤l胞(yu)样品中EGFR RNAH变?gu)和耐药性分析。(aQ纳c_^台检?zhn)者L1原代肿瘤l胞(yu)中EGFR L858RH变RNA的荧光图像。比例尺Q?00 μm。(bQ和QcQ采用纳c_^ChEGFR L858RH变QbQ或19外显子缺q变(cQ的原代肿瘤l胞(yu)样品中检到的突变细?yu)阳性率。(dQ和QeQ分别对EGFR L858RH变QdQ或19外显子缺q变(eQ的原代肿瘤l胞(yu)样品q行单细?yu)基因分析的qPCRl果。(fQ和QgQEGFRH变靶向药物厄洛替尼和吉非替对EGFR L858RH变QfQ或19外显子缺q变(gQ的原代肿瘤l胞(yu)的抑制作用?/span>
该文章第一/通讯单位为北航生物医学工E高_ְ创新中心和生物医学工E学院。第一作者是董再再博士。北京大学附属肿瘤医院吴楠教授和首都ȝ大学附属北京世纪坛医院薛新颖教授为共同通讯作者?
Reference: Z. Dong et al. Single Living Cell Analysis Nanoplatform for High-Throughput Interrogation of Gene Mutation and Cellular Behavior, Nano Letters, 2021, DOI: 10.1021/acs.nanolett.1c00199
董再再:(x)Nano LettersQ北航CHANG) .PDF