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血清蛋白-兒茶素復(fù)合物的計算機(jī)模擬研究  
血清蛋白-兒茶素復(fù)合物的計算機(jī)模擬研究
資料類型: JPG圖片格式
關(guān)鍵詞: :Replica  Exchange  Monte  Carlo(REMC)  兒茶素  血清蛋白  輸水相互作用  
復(fù)合物  
資料大?。?/td> 119K
所屬學(xué)科: 分子表征
來源: 2013年全國高分子學(xué)術(shù)論文報告會(2013.10.12~16,上海)
簡介:
兒茶素具有多種健康促進(jìn)作用,研究其與蛋白的相互作用對于解答相關(guān)生物活性和功能材料開發(fā)具有重要意義。盡管實驗上已有若干兒茶素與蛋白復(fù)合物的研究,然而卻沒有利用計算機(jī)模擬揭示該類復(fù)合物形成機(jī)制和分子相互作用分子等細(xì)節(jié)的報道。基于兒茶素與蛋白相互作用的特點,我們引入了具有方向依賴性的輸水相互作用,用以描述芳環(huán)之間的π堆砌作用。利用REMC模擬,我們考察了兒茶素與血清蛋白的摩爾比和體系的離子強(qiáng)度對復(fù)合物的影響,并對多個基于實驗的推測進(jìn)行了論證。我們發(fā)現(xiàn):僅有少量的兒茶素充當(dāng)橋聯(lián)作用以形成較大的復(fù)合物;增加兒茶素一方面會降低蛋白結(jié)合部位的特異選擇性,另一方面會抑制蛋白的自聚集行為;血清蛋白與兒茶素的強(qiáng)結(jié)合在約4.6個兒茶素時達(dá)到飽和,遠(yuǎn)低于實驗報道值。該方法對于在規(guī)模和細(xì)節(jié)平衡上研究其它蛋白復(fù)合物體系具有重要的參考價值。
作者: 李云琦,安立佳,Qingrong Huang
上傳時間: 2013-11-11 16:38:10
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