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| 資料類型： |
JPG圖片格式
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| 關鍵詞： |
腫瘤 蛋白質復合物 分子模擬 結合自由能 MM-PBSA 方法 |
| 資料大小： |
116K |
| 所屬學科： |
分子表征 |
| 來源： |
2013年全國高分子學術論文報告會（2013.10.12~16，上海） |
| 簡介： |
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腫瘤細胞的存活與否取決于其凋亡過程的分子調控能力，而一系列的蛋白質復合物是該過程得以行使的載體。其中，A1屬于促存活蛋白；而BMF、PUMA屬于促凋亡蛋白，稱之為BH3-only蛋白或BH3多肽。它們之間形成蛋白復合物，其結合的強弱直接影響著腫瘤細胞的凋亡過程。我們對A1蛋白和BH3多肽的復合物進行了分子模擬；基于MM-P(G)BSA方法，計算了幾種復合物的結合自由能及每個殘基的貢獻，發(fā)現(xiàn)不同多肽的結合機制存在差別；根據(jù)這一差別，對多肽進行突變，獲得了結合能力更強的蛋白－多肽復合物。研究發(fā)現(xiàn)，盡管BH3多肽中間的熱點殘基對結合能貢獻最大，但不同多肽結合能力的差異更多地體現(xiàn)在多肽的兩個末端片段上?；蛘哒f，多肽中間殘基的疏水作用體現(xiàn)了BH3多肽與A1蛋白結合機制的共性，而末端殘基更多地體現(xiàn)出不同BH3結合機制的特異性。此外，單次模擬軌跡只能覆蓋其末端片段的部分構象空間，相比而言，基于多趟軌跡獲得的結合自由能更加準確。 |
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| 作者： |
陳彥濤，李文飛，張建，王俊，王煒
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| 上傳時間： |
2013-11-11 16:40:38 |
| 下載次數(shù)： |
1 |
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2
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