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DNA 雜交機理的粗?;肿幽M研究  
DNA 雜交機理的粗粒化分子模擬研究
資料類型: JPG圖片格式
關(guān)鍵詞: DNA  雜交  分子模擬  拉鏈模型  
資料大?。?/td> 96K
所屬學(xué)科: 分子表征
來源: 2013年全國高分子學(xué)術(shù)論文報告會(2013.10.12~16,上海)
簡介:
DNA雜交機理是生物學(xué)領(lǐng)域一個廣受關(guān)注的基礎(chǔ)性問題,其成核細(xì)節(jié)尚不為人所知。Ouldridge等最近開發(fā)了一個新的粗?;疍NA模型—oxDNA,合理的擬合了DNA的氫鍵相互作用和堆疊相互作用,能夠同時表現(xiàn)DNA單鏈的柔性和雙鏈的剛性。到目前為止,該模型已經(jīng)成功的應(yīng)用于一系列的DNA結(jié)構(gòu)以及DNA納米器件的模擬,如DNA鑷子和DNA行走機器人。我們以該模型為基礎(chǔ),通過引入贗動力學(xué)(metadynamics)和過渡路徑采樣(transitionpathsampling)方法,研究了短鏈DNA的雜交機理和成核機理。研究結(jié)果表明,只有單一重復(fù)序列才采用“滑行式(slithering)”的雜交方式,不遵循特定的路徑;而對于一般隨機序列,其采用“拉鏈?zhǔn)剑▃ippering)”的雜交方式,有較為嚴(yán)格的形成路徑。
作者: 朱紅,梁好均
上傳時間: 2013-11-14 16:41:36
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