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資料類型: |
JPG圖片格式
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關(guān)鍵詞: |
DNA 雜交 分子模擬 拉鏈模型 |
資料大?。?/td>
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所屬學(xué)科: |
分子表征 |
來源: |
2013年全國高分子學(xué)術(shù)論文報告會(2013.10.12~16,上海) |
簡介: |
DNA雜交機理是生物學(xué)領(lǐng)域一個廣受關(guān)注的基礎(chǔ)性問題,其成核細(xì)節(jié)尚不為人所知。Ouldridge等最近開發(fā)了一個新的粗?;疍NA模型—oxDNA,合理的擬合了DNA的氫鍵相互作用和堆疊相互作用,能夠同時表現(xiàn)DNA單鏈的柔性和雙鏈的剛性。到目前為止,該模型已經(jīng)成功的應(yīng)用于一系列的DNA結(jié)構(gòu)以及DNA納米器件的模擬,如DNA鑷子和DNA行走機器人。我們以該模型為基礎(chǔ),通過引入贗動力學(xué)(metadynamics)和過渡路徑采樣(transitionpathsampling)方法,研究了短鏈DNA的雜交機理和成核機理。研究結(jié)果表明,只有單一重復(fù)序列才采用“滑行式(slithering)”的雜交方式,不遵循特定的路徑;而對于一般隨機序列,其采用“拉鏈?zhǔn)剑▃ippering)”的雜交方式,有較為嚴(yán)格的形成路徑。 |
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作者: |
朱紅,梁好均
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上傳時間: |
2013-11-14 16:41:36 |
下載次數(shù): |
1 |
消耗積分: |
2
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