益生菌和病原體的鑒別對(duì)人體健康有著非常重要的意義,具有高度特異性(包括菌株特異性)的微生物靶向療法因而也獲得了很大的關(guān)注。
蘇州大學(xué)陳高健教授、陳紅教授以及英國(guó)華威大學(xué) David M. Haddleton 教授等同合作者們利用大腸桿菌 MG1655 菌株作為活性模板,原位合成了一種具有高度選擇性的含糖聚合物。通過(guò)這種細(xì)菌-糖單體-適配聚合 (BS-MAP) 的方法,研究人員們?cè)诩?xì)菌表面上得到了可以識(shí)別兩種不同大腸桿菌菌株的含糖聚合物,并通過(guò)細(xì)菌聚集實(shí)驗(yàn)和 QCM-D 測(cè)量證實(shí)了這種含糖聚合物的特異性細(xì)菌結(jié)合能力。此外,這種含糖聚合物還表現(xiàn)出較強(qiáng)的抑菌能力,還可以防止細(xì)菌在共培養(yǎng)試驗(yàn)中傷害正常細(xì)胞。
相關(guān)工作以前沿論文 (Edge article) 發(fā)表在英國(guó)皇家化學(xué)會(huì)旗艦期刊 Chemical Science 上并入選 2019 Chemical Science HOT Article Collection。
研究背景
益生菌可保護(hù)宿主免受外界環(huán)境的侵害,而致病菌可能會(huì)引起傳染病?股赝ㄟ^(guò)殺滅病原體來(lái)治療細(xì)菌感染,但它們也可能殺滅非病原體,從而改變微生物群的組成并增加對(duì)繼發(fā)感染的易感性。另外,細(xì)菌菌株與細(xì)菌種類一樣重要,因?yàn)槲⑿〉耐蛔兛赡軐⒁嫔D(zhuǎn)化為相同種類的致病菌,一些非致命微生物甚至可能因此變得致命。因此,開(kāi)發(fā)微生物靶向性的抗菌療法就變得至關(guān)重要;這種藥劑應(yīng)具有高度的特異性,包括對(duì)菌株的特異性。
菌株 (strain) 也稱品系,是指同種細(xì)菌中不同來(lái)源的純培養(yǎng)物。具有典型特征的菌株稱為典型株或代表株或標(biāo)準(zhǔn)株。不同菌株可能性狀完全相同,也可能有某種微小差異。
在不同的選擇性試劑中,糖類在涉及信號(hào)識(shí)別和信號(hào)傳導(dǎo)的生物過(guò)程中起著重要的作用。一些糖對(duì)蛋白質(zhì)具有高親和力,使其在特異性方面展現(xiàn)出巨大優(yōu)勢(shì),因此人工合成的含糖聚合物能表現(xiàn)出很強(qiáng)的選擇性。然而,如何獲得在菌株水平上識(shí)別特定細(xì)菌的含糖聚合物仍需探索,而這樣的工作還尚未有報(bào)道。
本篇論文
本文作者選擇了合適的糖單體和聚合方法,以細(xì)菌為「活」模板,通過(guò)糖序列的優(yōu)化排列,原位合成了能實(shí)現(xiàn)菌株特異性親和的含糖聚合物。這種方法被稱為細(xì)菌-糖單體-適配聚合法 (bacteria-sugar monomer-aptation-polymerization, BS-MAP)。
鑒于大腸桿菌的基因型多樣性和操作便捷性,本文作者選擇大腸桿菌為模型細(xì)菌。所用的兩種單體是 MAG 和 MEDSA。
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MAG 是具有細(xì)菌結(jié)合能力的含糖單體;
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MEDSA 是不含糖的非結(jié)合單體,可以作為聚合物鏈中的間隔分子。
得益于大腸桿菌的還原性,這些單體以再生電子轉(zhuǎn)移催化 (activator regenerated electron transfer, ARGET) 機(jī)制進(jìn)行原子轉(zhuǎn)移自由基聚合 (atom transfer radical polymerization, ATRP),得到兩種聚合物:
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直接從溶液中獲得的聚合物(SP,可理解為 solution polymer);
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向體系中加入甘露糖 (mannose) 后從細(xì)菌表面上洗脫獲得的聚合物(BP,可理解為 bacteria polymer)。
細(xì)菌存在下的聚合過(guò)程示意圖,可以獲得兩種不同的聚合物 SP 和 BP。 |
本文作者還在沒(méi)有模版細(xì)菌存在的情況下進(jìn)行自由基聚合,制備出了非模板化的聚合物 (non-templated polymer, NP),以便與 SP 和 BP 進(jìn)行對(duì)比。SP 和 NP 中的糖含量都約為 30%,BP 中的糖含量則高達(dá)約 50%。此外,本文作者還根據(jù) BP 中的 MAG 和 MEDSA 含量,制備得到了和 BP 具有相同單體組成比例的聚合物 RP(可理解為「隨機(jī)聚合」Random Polymerization)。
細(xì)菌聚集試驗(yàn)和 QCM-D 測(cè)試證明了 BP 聚合物對(duì)細(xì)菌菌株的特異性,并且產(chǎn)生特異性的主要因素不是含糖聚合物中的糖含量以及 MAG 和 MEDSA 的比例,而是鏈的序列。通過(guò) BS-MAP 可以方便地獲得具有優(yōu)化的糖含量和鏈序列的含糖聚合物。共培養(yǎng)試驗(yàn)表明 BP 聚合物是細(xì)菌粘附的潛在抑制劑,也是內(nèi)皮細(xì)胞在金底物上附著和增殖的促進(jìn)劑。
該方法為人工合成的含糖聚合物的制備提供了一種方便和通用的策略,所報(bào)道的含糖聚合物對(duì)用作合成模板的細(xì)菌具有高度的特異性。該技術(shù)有望成為許多應(yīng)用的基礎(chǔ),例如細(xì)胞和微生物的標(biāo)記和捕獲等。本文入選 2019 Chemical Science HOT Article Collection。蘇州大學(xué)博士研究生羅妍為本論文的第一作者,David M. Haddleton 教授、陳高健教授、陳紅教授為本論文的共同通訊作者。
圖文解讀
本文作者首先使用細(xì)菌聚集實(shí)驗(yàn)來(lái)研究 BP 是否可以按預(yù)期與模板細(xì)菌進(jìn)行特異性的結(jié)合。除上述三種共聚物外,還合成 MAG 和 MEDSA 的均聚物 pMAG 和 pMEDSA 作為對(duì)照。為了測(cè)試聚合物的特異性,選擇了大腸桿菌菌株 DH5α (E. coli DH5α) 作為非模板細(xì)菌,其衍生自模板菌株大腸桿菌菌株 MG1655 (E. coli MG1655),只是基因組略有改變(屬于不同的菌株)。
圖 1. (A) 聚合物 NP、SP、RP、BP 引起的模板菌株 E. coli MG1655 和非模板菌株 E. coli DH5α 的聚集,兩種菌株均用 STYO9(綠色)染色。 如 (A) 所示,在各聚合物中,以 E. coli MG1655 為模板得到的 BP 聚集 MG1655 的能力最強(qiáng)。pMEDSA 引起的 MG1655 聚集非常少,可能是由于其作為兩性離子可抑制細(xì)菌的靠攏;pMAG 引起 MG1655 的部分聚集,但程度遠(yuǎn)低于 BP,表明較高的糖含量未必會(huì)獲得更高的親和力。NP 和 SP 引起少量的 MG1655 聚集,但程度小于 BP 和均聚物 pMAG。除了 BP 外,其它聚合物聚集非模板菌株 DH5α 的能力與它們對(duì)模板菌株 MG1655 的聚集能力類似。與 MG 1655 在 BP 溶液中的情況相比,BP 溶液中 DH5α 聚集簇的數(shù)量顯著減少,甚至低于 NP 中的結(jié)果。 |
上述結(jié)果表明,從模板菌株 E. coli MG1655 表面獲得的 BP 聚合物具有菌株特異性的親和力。對(duì)于涉及到復(fù)雜體系的「真實(shí)世界」,希望 BP 可以在兩種或更多種細(xì)菌組成的菌群中特異性地識(shí)別靶標(biāo)。因此,本文作者接下來(lái)測(cè)試的是 BP 在由模版菌和非模版菌組成的混合物中識(shí)別模版菌的能力。
圖 1. (B) 聚合物 NP、SP、RP、BP 引起的模板菌和非模板菌混合物中的分離和聚集狀態(tài);模板菌株用 STYO9(綠色)染色,非模板菌株用表達(dá)紅色熒光蛋白的靶基因修飾。 如 (B) 所示,在 NP 和 SP 的溶液中出現(xiàn)了一些細(xì)菌的聚集,紅色和綠色的熒光都有被觀察到,表明這兩種聚合物與細(xì)菌的結(jié)合較弱,且是非特異性的。RP 的情況下兩種細(xì)菌都只有部分聚集。對(duì)照明顯的是,在 BP 溶液中,觀察到大的綠色簇但未觀察到紅色簇,進(jìn)一步證實(shí) BP 在模版菌與非模板細(xì)菌的混合物中具有對(duì)模板菌株 MG1655 具有特異性的親和力。 |
圖 2. (A) 共聚物 RP、NP、SP、BP 的 13C-NMR 表征,核磁碳譜峰的典型差異。 如圖所示,在 –CH?– 碳的化學(xué)位移區(qū)域 (58 – 61 ppm),所有的其它共聚物都在 60.5 至 60.8 ppm 附近顯示出兩個(gè)寬峰,而只有共聚物 BP 顯示出兩個(gè)尖峰,它們被確定為 MAG 和 MEDSA 單體 –CH?–O– 上兩處化學(xué)環(huán)境不同的碳。 |
上述結(jié)果表明上述含糖聚合物的鏈序列不同,這也解釋了它們的特異性與結(jié)合能力差異。受限于現(xiàn)有的分析方法,BP精確的單體序列目前還無(wú)法確定。
接下來(lái),本文作者還通過(guò)耗散型石英晶體微天平 (Quartz Crystal Microbalance with Dissipation, QCM-D) 測(cè)量和金納米顆粒 (gold nano-particles, GNPs) 對(duì)含糖聚合物進(jìn)行進(jìn)一步的細(xì)菌結(jié)合能力評(píng)價(jià)。其中,QCM-D 是基于石英的壓電特性制備的一種表面敏感型分析技術(shù),能感應(yīng)到納克級(jí)的質(zhì)量變化,可以用于微生物吸附行為的研究。
圖 S14. 細(xì)菌層分別與聚合物 NP、SP、BP 溶液接觸情況下,QCM-D 頻率隨時(shí)間的變化:(A) 模板菌株 E. coli MG1655 和 (B) 非模板菌株 E. coli DH5α。(C) 為與聚合物 NP、SP、BP 溶液接觸后模版菌與非模板細(xì)菌層 QCM-D 頻率變化平均值。 如 (A) 所示,BP 對(duì)模板菌株 E. coli MG1655 的吸附是各聚合物中最高的,與細(xì)菌聚集實(shí)驗(yàn)的結(jié)果一致。如 (B) 所示,在非模板細(xì)菌株 DH5α 中,由 NP 和 SP 引起的頻率變化與模板菌類似。然而,DH5α 對(duì) BP 相對(duì)于 MG1655對(duì)BP 有著顯著的差異:首先是頻率快速降低,注入水后頻率又迅速增加,表明 BP 與非模板菌之間的相互作用很弱(被水輕易洗脫)。(C) 中給出的比較結(jié)果表明,BP 對(duì)模板菌的頻率變化大約是非模板菌的 47 倍,BP 對(duì)模板菌的特異性非常明顯。 |
圖 3. (A) 用含糖聚合物 SP 和 BP 修飾金納米顆粒 (gold nano-particles, GNPs) 的過(guò)程示意圖。(B) 修飾后的 GNPs 和模板菌 MG1655 之間的相互作用。 如圖所示,SP 修飾的 GNP 在細(xì)菌周?chē)S機(jī)分布,只有少數(shù)粘附到細(xì)菌上。相反,BP 修飾的 GNP 則大量出現(xiàn)在細(xì)菌表面附近,表明了 BP 和 MG1655 之間的特異性親和力。 |
在上述實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)成功地展示出 BP 特異性結(jié)合模版菌的特性后,本文作者接下來(lái)對(duì) BP 作為抗感染劑的可能性進(jìn)行了初步研究。作者推測(cè) BP 會(huì)占據(jù)特定細(xì)菌的結(jié)合位點(diǎn),從而阻止或削弱細(xì)菌與細(xì)胞的相互作用。本文所進(jìn)行的試驗(yàn)以內(nèi)皮細(xì)胞 (endothelial cells, ECs) 為模型:紡錘形細(xì)胞形態(tài)表明細(xì)胞功能較為健康,圓形細(xì)胞形態(tài)表明細(xì)胞活性較低。
圖 4. 含糖聚合物 BP、SP、NP 在抗感染實(shí)驗(yàn)中的抑菌作用。(A) 與細(xì)菌和不同聚合物孵育 12 小時(shí)后 ECs 的圖像:(1) 不含聚合物/空白;(2) 加入 BP;(3) 加入 SP;(4) 加入 NP。(B) 暴露于不同聚合物后,紡錘形 ECs 的百分比。 如圖所示,在暴露于細(xì)菌后,依然保持活性的 EC 細(xì)胞不到 20%。SP 和 NP 的引入改善了細(xì)胞活性率至約 50%,而在引入 BP 時(shí)幾乎所有細(xì)胞都呈活性較好的紡錘形。可見(jiàn)這些含糖聚合物可以抑制 MG1655 菌對(duì)正常細(xì)胞的傷害,而對(duì) MG1655 具有最高親和力的 BP 正是最有效的抗菌劑。 |
圖 5. BP 在金表面共培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中的抑制作用 (C + B: cells + bacteria)。EC 細(xì)胞核用 DAPI(藍(lán)色)染色,F(xiàn)-肌動(dòng)蛋白用 FITC(綠色)染色。(A) 金表面上不存在(C + B,左側(cè))與存在(C + B + BP,右側(cè))含糖聚合物 BP 的情況。(B) C + B 和 C + B + BP 情況下金表面上的 ECs密度。 如圖 (A) 所示,ECs 未能有效地與 MG1655 競(jìng)爭(zhēng),金表面幾乎未觀察到細(xì)胞,僅有的少數(shù)綠點(diǎn)可能是細(xì)胞的殘片。該結(jié)果表明 MG1655 細(xì)菌抑制了 EC 細(xì)胞的生長(zhǎng),甚至導(dǎo)致其死亡。當(dāng)存在 BP 時(shí),可見(jiàn) EC 細(xì)胞呈紡錘形,看起來(lái)更為健康。由 (B) 可知,BP 組中的細(xì)胞密度比無(wú) BP組高 8 倍,表明 BP 在金表面存在細(xì)菌的情況下可以促進(jìn) EC 的粘附和鋪展。 |
本文作者最后指出,雖然 BP 未必能完全阻止細(xì)菌的定植或完全消除細(xì)菌對(duì)正常細(xì)胞的負(fù)面影響,但通過(guò)引入殺菌基團(tuán)(如 Ag? 或季銨基團(tuán))等方法有望大大提高其抗菌性能。
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