中科院高性能科學(xué)計算在生命科學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用研討會在上海召開
2007-05-31 來源：中國聚合物網(wǎng)
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由中科院生物局聯(lián)合計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心主辦，上海生命科學(xué)研究院承辦的 “中科院高性能科學(xué)計算在生命科學(xué)研究領(lǐng)域應(yīng)用研討會”于 5月29日在上海舉行。來自北京基因組所、上海藥物所、計算生物所、系統(tǒng)生物學(xué)中心等上海生科院所屬研究所的專家，生物局和院信息辦的代表，以及計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心的相關(guān)人員等20余人出席了會議，共同探討高性能科學(xué)計算在生命科學(xué)研究領(lǐng)域的應(yīng)用與需求。
會上，計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心超級計算中心主任遲學(xué)斌研究員介紹了中科院超級計算環(huán)境與支撐服務(wù)情況，超級計算中心牛北方介紹了并行計算及其在生物科學(xué)研究中的應(yīng)用。北京基因組所王晶、上海藥物所熊兵、上海藥物所于坤千、計算生物所徐書華、系統(tǒng)生物學(xué)中心王川等分別介紹了高性能計算在基因組學(xué)研究、組合數(shù)學(xué)與幾何學(xué)研究、比較生物學(xué)研究、生物數(shù)據(jù)挖掘研究，生物大分子構(gòu)象變化研究，以及復(fù)雜生物分子模擬和藥物虛擬篩選等方面的研究和應(yīng)用需求。
與會代表就高性能計算的并行計算能力、軟件開發(fā)和移植、存儲需求、數(shù)據(jù)遠程傳輸?shù)确矫孢M行了熱烈的討論，并提出了很多寶貴的建議。專家們認為，生命科學(xué)研究對高性能計算機的需求日益增加，F(xiàn)有研究所的計算機資源已經(jīng)不能滿足日益增長的大規(guī)模數(shù)據(jù)和大計算量的需求、迫切需要引進更大處理能力的高性能計算機。生命科學(xué)領(lǐng)域一直是高性能計算的重要應(yīng)用領(lǐng)域，其中很多科學(xué)研究工作依賴于高性能計算機。由于現(xiàn)在國內(nèi)的計算資源與國際同行的差距日益加大，導(dǎo)致國內(nèi)的科學(xué)家的計算規(guī)模無法加大、應(yīng)用水平難以提高，在應(yīng)用科學(xué)研究中越來越被動，研究及成果與國際先進行列的差距不斷加大。如果不能及時引進新的高性能計算機系統(tǒng)，我國在基因組、生物制藥等生命科學(xué)領(lǐng)域的研究與應(yīng)用將在國際上失去目前的先進地位，無法實現(xiàn)自主創(chuàng)新的科研目標。
專家們認為，作為科學(xué)院信息化服務(wù)和支撐機構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)中心應(yīng)該配備百萬億次的高性能計算機，支撐研究所科學(xué)研究對高性能計算機的需求。網(wǎng)絡(luò)中心應(yīng)進一步加強與各研究所溝通，深入到學(xué)科領(lǐng)域，針對生命科學(xué)領(lǐng)域的高性能計算應(yīng)用特點，改善高性能計算環(huán)境，推動生命科學(xué)在網(wǎng)絡(luò)中心超級計算中心應(yīng)用的逐步深入。會議最后達成一致意見，研究所將各自計算量的需求統(tǒng)計整理，為院有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)和相關(guān)部門科學(xué)決策提供依據(jù)，以保證高性能計算資源更加科學(xué)合理地用，進而推動我院科研信息化的發(fā)展。
會上，計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心超級計算中心主任遲學(xué)斌研究員介紹了中科院超級計算環(huán)境與支撐服務(wù)情況，超級計算中心牛北方介紹了并行計算及其在生物科學(xué)研究中的應(yīng)用。北京基因組所王晶、上海藥物所熊兵、上海藥物所于坤千、計算生物所徐書華、系統(tǒng)生物學(xué)中心王川等分別介紹了高性能計算在基因組學(xué)研究、組合數(shù)學(xué)與幾何學(xué)研究、比較生物學(xué)研究、生物數(shù)據(jù)挖掘研究，生物大分子構(gòu)象變化研究，以及復(fù)雜生物分子模擬和藥物虛擬篩選等方面的研究和應(yīng)用需求。
與會代表就高性能計算的并行計算能力、軟件開發(fā)和移植、存儲需求、數(shù)據(jù)遠程傳輸?shù)确矫孢M行了熱烈的討論，并提出了很多寶貴的建議。專家們認為，生命科學(xué)研究對高性能計算機的需求日益增加，F(xiàn)有研究所的計算機資源已經(jīng)不能滿足日益增長的大規(guī)模數(shù)據(jù)和大計算量的需求、迫切需要引進更大處理能力的高性能計算機。生命科學(xué)領(lǐng)域一直是高性能計算的重要應(yīng)用領(lǐng)域，其中很多科學(xué)研究工作依賴于高性能計算機。由于現(xiàn)在國內(nèi)的計算資源與國際同行的差距日益加大，導(dǎo)致國內(nèi)的科學(xué)家的計算規(guī)模無法加大、應(yīng)用水平難以提高，在應(yīng)用科學(xué)研究中越來越被動，研究及成果與國際先進行列的差距不斷加大。如果不能及時引進新的高性能計算機系統(tǒng)，我國在基因組、生物制藥等生命科學(xué)領(lǐng)域的研究與應(yīng)用將在國際上失去目前的先進地位，無法實現(xiàn)自主創(chuàng)新的科研目標。
專家們認為，作為科學(xué)院信息化服務(wù)和支撐機構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)中心應(yīng)該配備百萬億次的高性能計算機，支撐研究所科學(xué)研究對高性能計算機的需求。網(wǎng)絡(luò)中心應(yīng)進一步加強與各研究所溝通，深入到學(xué)科領(lǐng)域，針對生命科學(xué)領(lǐng)域的高性能計算應(yīng)用特點，改善高性能計算環(huán)境，推動生命科學(xué)在網(wǎng)絡(luò)中心超級計算中心應(yīng)用的逐步深入。會議最后達成一致意見，研究所將各自計算量的需求統(tǒng)計整理，為院有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)和相關(guān)部門科學(xué)決策提供依據(jù)，以保證高性能計算資源更加科學(xué)合理地用，進而推動我院科研信息化的發(fā)展。
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