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DNA 雜交機(jī)理的粗?；肿幽M研究  
DNA 雜交機(jī)理的粗?；肿幽M研究
資料類型： JPG圖片格式
關(guān)鍵詞： DNA  雜交  分子模擬  拉鏈模型  
資料大?。?/td> 96K
所屬學(xué)科：
來源： 來源網(wǎng)絡(luò)
簡介：
DNA雜交機(jī)理是生物學(xué)領(lǐng)域一個廣受關(guān)注的基礎(chǔ)性問題，其成核細(xì)節(jié)尚不為人所知。Ouldridge等最近開發(fā)了一個新的粗粒化DNA模型—oxDNA，合理的擬合了DNA的氫鍵相互作用和堆疊相互作用，能夠同時表現(xiàn)DNA單鏈的柔性和雙鏈的剛性。到目前為止，該模型已經(jīng)成功的應(yīng)用于一系列的DNA結(jié)構(gòu)以及DNA納米器件的模擬，如DNA鑷子和DNA行走機(jī)器人。我們以該模型為基礎(chǔ)，通過引入贗動力學(xué)（metadynamics）和過渡路徑采樣（transitionpathsampling）方法，研究了短鏈DNA的雜交機(jī)理和成核機(jī)理。研究結(jié)果表明，只有單一重復(fù)序列才采用“滑行式（slithering）”的雜交方式，不遵循特定的路徑；而對于一般隨機(jī)序列，其采用“拉鏈?zhǔn)剑▃ippering）”的雜交方式，有較為嚴(yán)格的形成路徑。
上傳人： liu
上傳時間： 2013-11-14 16:41:36
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