殼聚糖酶酶解機制研究獲新進展
2016-07-22 來源:中國聚合物網(wǎng)
殼寡糖是殼聚糖經(jīng)降解處理后得到的一種聚合度為2-20的氨基寡糖產(chǎn)品,具有水溶性好、易吸收等優(yōu)點,為目前所知的唯一堿性寡糖,具有抗腫瘤、抗菌、免疫激活以及保濕等特點,在醫(yī)藥領域具有廣泛的應用前景。殼聚糖酶(chitosanase, EC 3.2.1.132)能特異性催化殼聚糖水解產(chǎn)生殼寡糖,催化條件溫和,并具有較高的催化速率,有利于實現(xiàn)殼寡糖的綠色工業(yè)化生產(chǎn)。殼聚糖酶屬于多個糖苷水解酶家族,其中以GH-46家族的殼聚糖酶的研究最為詳細,而對其他家族的殼聚糖酶了解甚少。GH-8家族殼聚糖酶與GH-46家族殼聚糖酶擁有類似的底物催化機制,但二者的晶體結(jié)構(gòu)有明顯的不同,且來源于不同的進化途徑。
中科院天津工業(yè)生物技術研究所宋江寧研究員帶領的結(jié)構(gòu)生物信息學與整合系統(tǒng)生物學研究組針對GH-8家族的殼聚糖酶的底物識別進行了一系列深入研究。該研究從殼聚糖酶的晶體結(jié)構(gòu)入手,對其底物識別中心的關鍵氨基酸殘基進行鑒定,并通過序列對比發(fā)現(xiàn)第318位Asp氨基酸高度保守;將Asp318進行定點突變?yōu)锳sn,Ala,Glu,Arg或Lys后,發(fā)現(xiàn)除D318N突變體外,其他的酶突變體活性均有明顯喪失。進一步的酶動力學分析發(fā)現(xiàn),突變體對底物的親和性明顯降低。分子內(nèi)相互作用分析表明,Asp318通過與Tyr273之間的氫鍵間接作用于底物,除了D318N突變體外,其他突變體都丟失了與Tyr273發(fā)生相互作用的氫鍵,從而影響了底物與酶的有效結(jié)合。本研究加深了對GH-8家族殼聚糖酶酶解機制的了解,為殼聚糖酶的分子改造及工業(yè)化應用奠定了基礎。
該研究得到中國科學院“百人計劃”(擇優(yōu))、中國科學院知識創(chuàng)新工程項目(KSCX2-EW-G-8)和天津市重大科技攻關項目(10ZCKFSY05600)的資助。研究結(jié)果發(fā)表在SCI雜志Applied Biochemistry and Biotechnology上,中國科學院天津工業(yè)生物技術研究所助理研究員周站平為論文第一作者。
中科院天津工業(yè)生物技術研究所宋江寧研究員帶領的結(jié)構(gòu)生物信息學與整合系統(tǒng)生物學研究組針對GH-8家族的殼聚糖酶的底物識別進行了一系列深入研究。該研究從殼聚糖酶的晶體結(jié)構(gòu)入手,對其底物識別中心的關鍵氨基酸殘基進行鑒定,并通過序列對比發(fā)現(xiàn)第318位Asp氨基酸高度保守;將Asp318進行定點突變?yōu)锳sn,Ala,Glu,Arg或Lys后,發(fā)現(xiàn)除D318N突變體外,其他的酶突變體活性均有明顯喪失。進一步的酶動力學分析發(fā)現(xiàn),突變體對底物的親和性明顯降低。分子內(nèi)相互作用分析表明,Asp318通過與Tyr273之間的氫鍵間接作用于底物,除了D318N突變體外,其他突變體都丟失了與Tyr273發(fā)生相互作用的氫鍵,從而影響了底物與酶的有效結(jié)合。本研究加深了對GH-8家族殼聚糖酶酶解機制的了解,為殼聚糖酶的分子改造及工業(yè)化應用奠定了基礎。
該研究得到中國科學院“百人計劃”(擇優(yōu))、中國科學院知識創(chuàng)新工程項目(KSCX2-EW-G-8)和天津市重大科技攻關項目(10ZCKFSY05600)的資助。研究結(jié)果發(fā)表在SCI雜志Applied Biochemistry and Biotechnology上,中國科學院天津工業(yè)生物技術研究所助理研究員周站平為論文第一作者。
原文鏈接:http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs12010-016-2159-8
Asp318及其突變體與周圍氨基酸之間的相互作用
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